Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc81Q9D5W4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc81Q9D5W4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms