Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap53Q9D439 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap53Q9D439 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfap53Q9D439 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap53Q9D439 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms