Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933425L06RikQ9D3Z8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933425L06RikQ9D3Z8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms