Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rsph14Q9D3W1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rsph14Q9D3W1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rsph14Q9D3W1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rsph14Q9D3W1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms