Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag1Q9D3E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag1Q9D3E6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag1Q9D3E6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms