Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Necap2Q9D1J1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Necap2Q9D1J1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms