Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd3Q9D176 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd3Q9D176 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms