Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca7Q9D0M2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca7Q9D0M2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca7Q9D0M2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms