Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed3Q9D0L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed3Q9D0L1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed3Q9D0L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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