Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2e1Q9D0D5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gtf2e1Q9D0D5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms