Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ribc1Q9D0B8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ribc1Q9D0B8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.6 ms