Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc47Q9D024 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc47Q9D024 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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