Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elp3Q9CZX0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elp3Q9CZX0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Elp3Q9CZX0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elp3Q9CZX0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elp3Q9CZX0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp3Q9CZX0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp3Q9CZX0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp3Q9CZX0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.9 ms