Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BccipQ9CWI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BccipQ9CWI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms