Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc3Q9CW03 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc3Q9CW03 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc3Q9CW03 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms