Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms