Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CRC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CRC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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