Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5sQ9CRA7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5sQ9CRA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5sQ9CRA7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms