Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmbQ9CR53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmbQ9CR53 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms