Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmd9Q9CR00 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd9Q9CR00 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd9Q9CR00 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms