Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg12Q9CQY1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg12Q9CQY1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms