Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim8Q9CQQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms