Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rwdd1Q9CQK7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rwdd1Q9CQK7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rwdd1Q9CQK7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms