Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufb9Q9CQJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287 ms