Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc4Q99PH1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc4Q99PH1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms