Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmfQ99NF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmfQ99NF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms