Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b1Q99NB9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b1Q99NB9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b1Q99NB9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms