Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a6dQ99N07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms