Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PccbQ99MN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PccbQ99MN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PccbQ99MN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms