Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99KU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99KU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99KU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99KU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99KU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q99KU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q99KU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q99KU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q99KU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q99KU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q99KU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q99KU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q99KU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms