Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clint1Q99KN9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clint1Q99KN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms