Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lims1Q99JW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lims1Q99JW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms