Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfxn1Q99JR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfxn1Q99JR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfxn1Q99JR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms