Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg5Q99J83 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms