Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddb2Q99J79 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms