Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Derl1Q99J56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl1Q99J56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl1Q99J56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms