Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfdQ925I7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PdgfdQ925I7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfdQ925I7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms