Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prss28Q924N9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prss28Q924N9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms