Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf3Q920N1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms