Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med28Q920D3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms