Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc1Q91Z38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc1Q91Z38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc1Q91Z38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms