Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Exosc2Q8VBV3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exosc2Q8VBV3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms