Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top1mtQ8R4U6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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