Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip5Q8R361 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip5Q8R361 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms