Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup58Q8R332 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup58Q8R332 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms