Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim29Q8R2Q0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim29Q8R2Q0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms