Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh16f2Q8K3M1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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