Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrtm1Q8K377 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrtm1Q8K377 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms