Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Depp1Q8K2F3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Depp1Q8K2F3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms