Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Q4Q8HWB2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2-Q4Q8HWB2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms